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• 國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

  • >應(yīng)用表面物理國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >集成芯片與系統(tǒng)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >遺傳工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >醫(yī)學(xué)神經(jīng)生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >聚合物分子工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 國(guó)家數(shù)學(xué)中心

  • >上海數(shù)學(xué)中心

• 國(guó)家教材建設(shè)重點(diǎn)研究基地

  • >高校新聞學(xué)教材研究基地

• 國(guó)家臨床醫(yī)學(xué)研究中心

  • >老年疾病國(guó)家臨床醫(yī)學(xué)研究中心
  • >介入治療國(guó)家臨床醫(yī)學(xué)研究中心

• 國(guó)家制造業(yè)創(chuàng)新中心

  • >國(guó)家集成電路創(chuàng)新中心

• 教育部人文社科基地

  • >中國(guó)古代文學(xué)研究中心
  • >歷史地理研究中心
  • >當(dāng)代國(guó)外馬克思主義研究中心
  • >中國(guó)社會(huì)主義市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)研究中心
  • >信息與傳播研究中心
  • >美國(guó)研究中心
  • >世界經(jīng)濟(jì)研究所
  • >中外現(xiàn)代化進(jìn)程研究中心

• 前沿科學(xué)中心

  • >腦科學(xué)前沿中心

• 省部共建創(chuàng)新協(xié)同中心

  • >長(zhǎng)三角集成電路設(shè)計(jì)與制造協(xié)同創(chuàng)新中心

• 新農(nóng)村研究院

  • >新農(nóng)村發(fā)展研究院

• 教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

  • >計(jì)算神經(jīng)科學(xué)與類腦智能教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >核物理與離子束應(yīng)用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >特性材料與技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（B類）
  • >癌變與侵襲原理教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >公共衛(wèi)生安全教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >智能化遞藥教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >代謝分子醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >醫(yī)學(xué)分子病毒學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >微納光子結(jié)構(gòu)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >計(jì)算物質(zhì)科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >生物多樣性與生態(tài)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >現(xiàn)代人類學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >電磁波信息科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >非線性數(shù)學(xué)模型與方法教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 教育部工程研究中心

  • >先進(jìn)涂料教育部工程研究中心
  • >基因技術(shù)教育部工程研究中心
  • >網(wǎng)絡(luò)信息安全審計(jì)與監(jiān)控教育部工程研究中心
  • >創(chuàng)新科學(xué)儀器教育部工程研究中心
  • >先進(jìn)照明技術(shù)教育部工程研究中心
  • >心血管介入治療技術(shù)與器械教育部工程研究中心
  • >智能機(jī)器人教育部工程研究中心

• 上海市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

  • >上海市現(xiàn)代應(yīng)用數(shù)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市分子催化與功能材料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市智能信息處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市大氣顆粒物污染防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市數(shù)據(jù)科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市針灸機(jī)制和穴位功能重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市醫(yī)學(xué)圖像處理與計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市周圍神經(jīng)顯微外科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市器官移植重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市女性生殖內(nèi)分泌相關(guān)疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市視覺(jué)損害與重建重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市乳腺腫瘤重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市出生缺陷防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市老年醫(yī)學(xué)臨床重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >上海市腎臟疾病與血液凈化重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 上海工程技術(shù)研究中心

  • >上海超精密光學(xué)制造工程技術(shù)研究中心
  • >上海工業(yè)菌株工程技術(shù)研究中心
  • >上海消化內(nèi)鏡診療工程技術(shù)研究中心
  • >上海分子影像探針工程技術(shù)研究中心
  • >上海手性藥物工業(yè)不對(duì)稱催化工程技術(shù)研究中心
  • >上海重要產(chǎn)品追溯工程技術(shù)研究中心
  • >上海結(jié)直腸腫瘤微創(chuàng)工程技術(shù)研究中心
  • >上海區(qū)塊鏈工程技術(shù)研究中心
  • >上海智能機(jī)器人工程技術(shù)研究中心
  • >上海心肺疾病人工智能工程技術(shù)研究中心
  • >上海心臟瓣膜工程技術(shù)研究中心

• 衛(wèi)健委重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

  • >衛(wèi)健委新生兒疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委近視眼研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委糖復(fù)合物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委聽(tīng)覺(jué)醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委病毒性心臟病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委手功能重建重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委抗生素臨床藥理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >衛(wèi)健委醫(yī)學(xué)分子病毒學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 野外臺(tái)站（國(guó)家林業(yè)局）

  • >上海崇明東灘濕地生態(tài)系統(tǒng)定位觀測(cè)研究站

• 國(guó)家國(guó)際科技合作基地（科技部）

  • >儲(chǔ)能技術(shù)示范型國(guó)際科技合作基地
  • >現(xiàn)代人類學(xué)示范型國(guó)際科技合作基地
  • >氣候和環(huán)境變化研究示范型國(guó)際科技合作基地
  • >發(fā)育與疾病國(guó)際聯(lián)合研究中心
  • >醫(yī)學(xué)表觀遺傳與分子代謝國(guó)際科技合作基地

• 國(guó)際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室（教育部）

  • >遺傳與發(fā)育國(guó)際合作聯(lián)合研究中心

• 創(chuàng)新引智基地

  • >量子調(diào)控創(chuàng)新引智基地
  • >先進(jìn)材料科學(xué)與技術(shù)創(chuàng)新引智基地
  • >現(xiàn)代應(yīng)用數(shù)學(xué)創(chuàng)新引智基地
  • >人類遺傳學(xué)創(chuàng)新引智基地
  • >功能納米材料系統(tǒng)工程創(chuàng)新引智基地
  • > 腦發(fā)育與重塑創(chuàng)新引智基地
  • >持續(xù)性感染與疾病創(chuàng)新引智基地
  • >計(jì)算神經(jīng)科學(xué)與類腦智能學(xué)科創(chuàng)新引智基地

• 上海市協(xié)同創(chuàng)新中心

  • >長(zhǎng)三角集成電路設(shè)計(jì)與制造協(xié)同創(chuàng)新中心
  • >上海藥物創(chuàng)制產(chǎn)業(yè)化開(kāi)發(fā)中心

• 上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)

  • >上海市微電子材料與元器件微分析專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)
  • >上海市微納器件與工藝專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)
  • >上海市重大疾病蛋白質(zhì)組研究專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)
  • >上海市惡性腫瘤生物樣本庫(kù)專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)

• 上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

  • >量子調(diào)控上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >心力衰竭上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >蛋白質(zhì)化學(xué)生物學(xué)上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • >表觀遺傳學(xué)上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
  • > 小分子活性物質(zhì)上海高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 上海市教委上海高校工程研究中心

  • >視頻技術(shù)與系統(tǒng)上海高校工程研究中心
  • >電子與光電子材料及器件分析技術(shù)上海高校工程研究中心

• 上海高校E-研究院

  • >健康領(lǐng)域重大社會(huì)問(wèn)題治理上海高校E研究院

• 校級(jí)實(shí)體化運(yùn)行科研機(jī)構(gòu)

  • >發(fā)展研究院
  • >高等學(xué)術(shù)研究院
  • >出土文獻(xiàn)與古文字研究中心
  • >高等教育研究所
  • >古籍整理研究所
  • >國(guó)際問(wèn)題研究院
  • >科技考古研究院
  • >六次產(chǎn)業(yè)研究院
  • >馬克思主義研究院
  • >望道研究院
  • >全球公共政策研究院
  • >社會(huì)科學(xué)高等研究院
  • >文史研究院
  • >現(xiàn)代語(yǔ)言學(xué)研究院
  • >一帶一路及全球治理研究院
  • >中國(guó)歷史地理研究所
  • >中國(guó)研究院
  • >大氣科學(xué)研究院
  • >大數(shù)據(jù)試驗(yàn)場(chǎng)研究院
  • >大數(shù)據(jù)研究院
  • >代謝與整合生物學(xué)研究院
  • >復(fù)雜體系多尺度研究院
  • >工程與應(yīng)用技術(shù)研究院
  • >類腦芯片與片上智能系統(tǒng)研究院
  • >類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院
  • >人類表型組研究院
  • >上海數(shù)學(xué)中心
  • >手性分子工程中心
  • >微納電子器件與量子計(jì)算機(jī)研究院
  • >先進(jìn)材料實(shí)驗(yàn)室
  • >專用材料與裝備技術(shù)研究院
  • >智能復(fù)雜體系基礎(chǔ)理論與關(guān)鍵技術(shù)實(shí)驗(yàn)室
  • >智能機(jī)器人研究院
  • >放射醫(yī)學(xué)研究所
  • >腦科學(xué)研究院
  • >生物醫(yī)學(xué)研究院
  • >實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心
  • >腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院
  • >生殖與發(fā)育研究院（籌）
  • >芯片與系統(tǒng)前沿技術(shù)研究院
  • >光電研究院（籌）
  • >人工智能創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)研究院（籌）
  • >感染與健康研究院（籌）
  • >科技倫理與人類未來(lái)研究院（籌）
  • >應(yīng)用數(shù)學(xué)中心（籌）
  • >金融科技研究院（籌）
  • >法庭科學(xué)研究院（籌）
  • >醫(yī)學(xué)遺傳研究院（籌）
  • >智慧納米機(jī)器人與納米系統(tǒng)國(guó)際研究院（籌）
  • >空間互聯(lián)網(wǎng)研究院（籌）

• 地方合作機(jī)構(gòu)

  • >復(fù)旦大學(xué)泰州健康科學(xué)研究院
  • >復(fù)旦大學(xué)無(wú)錫研究院
  • >復(fù)旦大學(xué)寧波研究院
  • >上海浦東復(fù)旦大學(xué)張江科技研究院
  • >復(fù)旦大學(xué)青島研究院
  • >珠海復(fù)旦創(chuàng)新研究院
  • >山東復(fù)旦研究院
  • >中山復(fù)旦聯(lián)合創(chuàng)新中心
  • >復(fù)旦大學(xué)義烏研究院
  • >粵港澳大灣區(qū)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院（廣州）
  • >章丘復(fù)旦聯(lián)合創(chuàng)新中心
  • >嘉善復(fù)旦研究院
  • >成都市復(fù)旦西部國(guó)際金融研究院
  • >衢州復(fù)旦研究院