目前學(xué)校理工醫(yī)科有數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院、物理學(xué)系、化學(xué)系、高分子科學(xué)系、環(huán)境科學(xué)與工程系、信息科學(xué)與工程學(xué)院、計算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院、軟件學(xué)院、微電子學(xué)院、材料科學(xué)系、航空航天系、生命科學(xué)學(xué)院、大數(shù)據(jù)學(xué)院、大氣與海洋科學(xué)系/大氣科學(xué)研究院、類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、放射醫(yī)學(xué)研究所、現(xiàn)代物理研究所/核科學(xué)與技術(shù)系、神經(jīng)生物研究所、發(fā)育生物研究所、先進(jìn)材料實驗室、生物醫(yī)學(xué)研究院、腦科學(xué)研究院、人類表型組研究院等27個院系（所）。
學(xué)?，F(xiàn)有國家平臺基地9個，包括國家重點實驗室5個，國家臨床醫(yī)學(xué)研究中心2個，國家制造業(yè)創(chuàng)新中心1個，以及上海數(shù)學(xué)中心。現(xiàn)有各類省部級平臺基地80個，包括科技部新農(nóng)村研究院1個，教育部前沿科學(xué)中心1個，教育部重點實驗室13個，教育部工程技術(shù)研究中心7個，教育部國際合作聯(lián)合實驗室1個，科技部國家國際科技合作基地5個，國家外專局學(xué)科創(chuàng)新引智基地8個，衛(wèi)健委重點實驗室9個，總后衛(wèi)生部重點實驗室1個，國家林業(yè)局野外臺站1個，上海市重點實驗室15個，上海市工程中心11個，省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心1個，上海市協(xié)同創(chuàng)新中心2個，上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺4個。
近年來，學(xué)?？萍脊ぷ魇冀K堅持圍繞服務(wù)國家戰(zhàn)略和社會需求，承接國家和上海市重大科研項目，科研項目和經(jīng)費規(guī)模穩(wěn)步增長，科研能力逐步提升。從2016年到2018年，理科科技到款經(jīng)費總計68.85億元，獲批牽頭承擔(dān)國家重點研發(fā)計劃66項，承擔(dān)國家自然科學(xué)基金2013項，新建校企聯(lián)合實驗室7家，獲得國家獎項目獎3項、中華人民共和國國際科學(xué)技術(shù)合作獎1項、省部級一等獎18項、省部級人才獎3項，獲得專利授權(quán)1049項。
新形勢下，學(xué)校利用學(xué)科優(yōu)勢，提升社會服務(wù)能力，與地方政府共建張江研究院、無錫研究院和寧波研究院，與26個省市及地方政府簽署科技合作協(xié)議；同時，通過創(chuàng)新轉(zhuǎn)化機(jī)制，走出了一條具有復(fù)旦特色的成果轉(zhuǎn)化之路，2016年學(xué)校簽訂的專利許可/轉(zhuǎn)讓合同金額超過5億元。
復(fù)旦大學(xué)科學(xué)技術(shù)研究院負(fù)責(zé)統(tǒng)籌管理學(xué)校理工醫(yī)科科研。
